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AgroParisTech

Le Vivant, notre vocation

Former, Chercher, Innover Pour l’avenir de l’agriculture, de l’alimentation et de la forêt.

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Doctorants AgroParisTech / AgroParisTech doctoral candidates

AgroParisTech est un établissement constitutif de l’Ecole Doctorale ABIES (Agriculture - Alimentation - Biologie - Environnements - Santé). ABIES compte environ 450 doctorants, dont 350 inscrits à AgroParisTech (tous secteurs scientifiques confondus). Chaque année, environ 70 thèses sont soutenues à AgroParisTech, dont de 3 à 7 dans le domaine de la génétique animale. Les thèses soutenues à AgroParisTech sont en principe mises en ligne sur le site ’Pastel’ de ParisTech, et dans la liste des thèses soutenues, nous fournissons le lien correspondant à chacune des thèses effectivement mises en ligne.

AgroParisTech is a founder part of the graduate school ABIES (agriculture - food - biology - environments - health). There are about 350 PhD candidates registred in AgroParisTech and a total of about 450 PhD candidates in ABIES (all scientific fields). Each year, about 70 PhD thesis are defended, including from 3 to 7 in the field of animal breeding and genetics.

Thèses en cours / Ongoing PhD thesis

Liste par date d’inscription / List by date of enrollment

2017 Ronan GRIOT Développement d’outils et méthodes de sélection génomique pour le bar et la daurade
2017 Jonathan d’AMBROSIO Sélection génomique chez la truite arc-en-ciel
2016 Sébastien TAUSSAT Etude du déterminisme génétique de l’efficacité alimentaire en bovins allaitants en vue d’une possible prise en compte dans les évaluations génomiques bovines
2016 Clémentine ESCOUFLAIRE Détection de polymorphismes génétiques au niveau du génome mitochondrial et des chromosomes sexuels et caractérisation de leurs effets sur les caractères de production, reproduction et santé
2016 Marie BERODIER Utilisation des données de génotypage en ferme pour une gestion optimisée et durable de l’élevage laitier
2016 Marie-Pierre SANCHEZ Analyse génétique de la composition protéique et des aptitudes fromagères du lait de vache prédites à partir des spectres MIR
2015 Hadeer ABOSHADY Biomarkers allowing the sustainable breeding for genetic resistance to gastro-intestinal nematodes in small ruminants under a tropical environment
2015 Md Mesbah UDDIN Identification of causal factors for recessive genetic defects for embryonic lethality in dairy cattle combining whole exome and genome sequencing

Thèses soutenues / Defended PhD thesis

Liste par date de soutenance / List by date of defense

2018 Clémence FRASLIN Bases génétiques de la réponse à l’infection par Flavobacterium psychrophilum chez la truite arc-en-ciel : approche expérimentale et perspectives en sélection
2018 Andrew MARETTE Use of large scale cow genotyping to dissect the genetic determinism of complex traits beyond additive effects
2018 Alma RYSKALIYEVA Exploring the fine composition of Camelus milk from Kazakhstan with emphasis on protective components
2018 Mathieu TIRET Approche multi-locus du génome dans les modèles de génétique des populations
2018 Shizhi WANG Selection for health in purebred dog
2018 Sonia EYNARD Genetic erosion and long term genetic improvement
2018 Patrick AZEMA Caractérisation des paramètres génétiques de la résistance à certains agents infectieux chez l’huître creuse, Crassostea gigas, dans le cadre de surmortalités estivales
2018 Doreen SCHWOCHOW Molecular identification of colour gene patterns in birds
2017 Zih-Hua FANG Genomics of bovine milk protein composition
2017 Iola CROUE Evaluation génétique et génomique de nouveaux caractères chez les bovins laitiers
2017 Christina ROCHUS Genetics of coat colour and reproduction traits in sheep
2017 Tao XIANG Genomic evaluation with cross-bred and pure-bred animals
2017 Pauline MICHOT Utilisation des séquences ‘génome complet’ de taureaux fondateurs pour identifier des mutations délétères et améliorer la connaissance de la fonction des gènes bovin
2017 Parsaoran SILALAHI Experimental assessment of the effects of selection on reproduction and robustness traits in a Large White pig population
2017 Mathieu BESSON Using life cycle assessment to design breeding programs in aquaculture that balance productivity with environmental sustainability
2016 David JONAS Evaluation of haplotype-based genomic selection methods with focus on their performances in a multi-breed context in dairy cattle
2016 Alexis MICHENET Détection de QTL et sélection génomique des qualités maternelles des vaches allaitantes
2016 Belén JIMENEZ MENA Estimation of the effective population size (Ne) and its application in the management of small populations
2015 Edin HAMZIC Innate and adaptative immune parameters controlling two major diseases in chicken
2015 Irene VAN Den BERG Use of whole sequence data in genomic selection of dairy cattle
2014 Chris HOZE Evaluation génomique multiraciale des bovins laitiers
2013 Muhammad Zahid TAHIR Rôle et mécanismes d’action de la progestérone pendant la période périovulatoire chez la chienne
2013 Clémence DESJARDIN Bases moléculaires et physiopathologiques de la prédisposition à l’ostéochondrose équine
2013 Thierry TRIBOUT Intérêt de la sélection génomique dans les programmes de sélection porcins : cas d’une lignée mâle de grande taille
2013 Eloi VERRIER Bases génétiques de la résistance aux rhabdovirus et réponse cellulaire chez la truite arc-en-ciel : importance des mécanismes de défense innés
2012 Lucie CHEVALLIER Recherche de facteurs génétiques contrôlant la résistance de lignées de souris consanguines à une infection expérimentale par Yersinia pestis, l’agent de la peste
2012 Pauline BRENAUT Analyse fonctionnelle des mécanismes protecteurs des épithéliums induits par la sérum amyloïde A3
2012 Coralie DANCHIN-BURGE Combinaison de stratégies in situ et ex situ pour la gestion durable de la variabilité génétique des populations animales
2012 Romain SAINTILAN Etude de nouvelles approches pour la sélection sur l’efficacité alimentaire chez le porc en croissance et des
perspectives de leur mise en place
2012 Bérénice HUQUET Adaptation de la sélection à la diversité des systèmes d’élevages en bovins laitiers
2012 Marc VANDEPUTTE Genetic variation of growth and sex ratio in the European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) as revealed by molecular pedigrees
2012 Romain DASSONNEVILLE Genomic selection of dairy cows
2012 Mohamed KILEH WAIS Méthodes statistiques pour la détection de QTL : nouveaux développements et applications chez le canard mulard
2012 Mélanie JAQUOT-GUNIA Optimisation d’un programme de sélection de petits ruminants en milieu tropical
2011 Richard LE BOUCHER Génétique de l’utilisation d’aliments d’origine végétale chez la truite arc-en-ciel et le bar européen
2011 Clotilde PRATY Impacts of genomic selection on classical genetic evaluations
2011 Btissam SALMI Méta-analyse et analyse multidimensionnelle : applications à la qualité de la viande de porc
2011 Sophie ALLAIS Détection et validation de marqueurs génétiques impliqués dans la qualité de la viande bovine
2011 Chih-Sheng CHANG A global approach of chicken genetic diversity in Taiwan, combining phenotypes and molecular markers
2011 Didier BOUCHEL Caractérisation et cartographie des ressources génétiques caprines du Sénégal
2010 Aurélien CAPITAN Caractérisation moléculaire de régions chromosomiques intervenant dans la variabilité de caractères d’intérêt chez les bovins laitiers
2010 Laure GRIMA Etude des variations génétiques de la croissance et du sex-ratio chez le bar à partir de pedigrees moléculaires
2010 Olympe CHAZARA Diversité génétique structurale et fonctionnelle du CMH chez le poulet : implication pour la résistance aux maladies
2010 Julien MARUOTTI Comparison of epiblast stem cells from mouse fertilized and nuclear transfer embryos,
and attempts to obtain embryo-derived pluripotent stem cells in a species of economic interest
2009 Charlène BLANCHET Identification des facteurs génétiques contrôlant la résistance de lignées de souris consanguines
à une infection expérimentale par Yersina pestis, l’agent de la peste
2009 Alban BOUQUET Amélioration de l’efficacité des programmes de sélection des bovins allaitants : de nouveaux modèles d’évaluation génétique
2009 François GUILLAUME Intégration de l’information moléculaire dans l’évaluation génétique
2009 Guillemette MAROT Modélisation statistique pour l’analyse des données d’expression des gènes
2009 Slim BEN JEEMA Cartographie fine des régions génomiques impliquées dans la variation des caractères de fertilité femelle des bovins
2009 Félicie FAUCON Effet du polymorphisme au locus DGAT1 sur l’activité transcriptionnelle du tissu mammaire au cours de la lactation
2008 Hélène LECLERC Mise en place d’une évaluation génétique sur les contrôles élémentaires en bovins laitiers et perspectives d’utilisation des résultats en appui technique
2008 Jean-Claude FOTSA Caractérisation des populations de poules locales (Gallus gallus) au Cameroun
2008 Mylène DUVAL Modélisation et estimation de variances hétérogènes
2008 Catherine RYHLMANN Vers une évaluation génétique internationale des chevaux pour les performances en saut d’obstacle
2008 Grégoire LEROY Diversité et gestion génétique des races canines
2008 Cécile BERTHOULY Characterisation of the cattle, buffalo and chicken populations in the Northern Vietnamese province of Ha Giang
2008 Ingrid DAVID Analyse génétique et modélisation de la production de semence et de la réussite de l’insémination artificielle en ovin
2008 Florence YTOURNEL Déséquilibre de liaison et cartographie de QTL en population sélectionnée
2007 Adeline LAMBERT-DERKIMBA L’inscription du type génétique dans les règlements techniques des produits animaux sous AOP : enjeux et conséquences pour la gestion collective des ressources génétiques
2007 Valérie LOYWYCK Analysis of the within-population genetic diversity and the effective size based on different kinds of information in selected animal populations
2007 Clotilde DUBOIS Modélisation des programmes de sélection dans l’élevage du cheval de sport français
2007 Giulietta MINOZZI Characterisation of chicken lines selected on immune response : Crossbreeding and disease resistance
2007 Anne LAUVIE Gérer les populations animales locales à petits effectifs : approche de la diversité des dispositifs mis en oeuvre
2007 Adalberto ROSENDO PONCE Approches quantitatives et moléculaires de l’analyse de la variabilité génétique des performances de reproduction des truies
2006 Laurianne CANARIO Caractérisation et étude de la variabilité génétique de la survie des porcelets en allaitement précoce
2006 Lydie N’DRI Interactions génotype x milieu chez le poulet
2006 Jean-Luc GOURDINE Analyse des contraintes du milieu tropical humide sur les performances des truies
2006 Chung-Ming CHANG Identification de la base moléculaire de phénotypes présentant différentes colorations de plumage chez le poulet
2004 Sara CASU Détection de QTL chez la brebis laitière, à partir du croisement entre les races Lacaune et Sarde
2003 Michel NAVES Caractérisation et gestion d’une population bovine locale de la zone tropicale : le bovin Créole de Guadeloupe
2003 Zulma VITEZICA Modèles d’hérédité mixte pour l’évaluation génétique des animaux
2003 Isabelle DELAUNAY Méthodologie des évaluations génétiques internationales chez les bovins laitiers
2003 Carole MORENO Analyse génétique de la sensibilité des ovins à deux pathologies infectieuses, la salmonellose et de la tremblante
2003 Hélène GILBERT Multidimensionnalité dans la détection de gènes influençant les caractères quantitatifs. Application au porc
2003 Mathieu GAUTIER Analyse fine d’une région du génome bovin
2002 Chih-Feng CHEN Etude de l’adaptation à la chaleur de lignées de poules pondeuses combinant deux gènes majeurs
2001 Guillaume LAVAL Choix des marqueurs et des méthodes pour la caractérisation génétique des races d’animaux domestiques
2000 Marie-Madeleine MIALON La reproduction des vaches allaitantes : analyse de la variabilité individuelle et des relations entre les composantes de la reproduction
2000 Marie-Noëlle FOUILLOUX Evaluation génétique des bovins allaitants sur performances bouchères post-sevrage
2000 Rachel RUPP Analyse génétique de la résistance aux mam-mites chez les ruminants laitiers
1999 Virginie CLEMENT Amélioration génétique des petits ruminants en milieu villageois africain
1999 Hector TADDEO Amélioration génétique de la chèvre Angora en vue de la production de mohair
1999 Sandrine MIGNON Etude génétique du dimorphisme sexuel chez les volailles domestiques
1998 Sophie LAUNAY Recherches de marqueurs génétiques et évaluation de la variabilité chez l’huitre plate Ostrea edulis pour la résistance au parasite Bonamia oestrae
1998 Valérie KERDILES Amélioration de la taille de portée chez le lapin : création et diffusion du progrès génétique
1998 Bertrand COLLET Etude des bases génétiques de la variabilité des caractères physiologiques impliqués dans la croissance de l’huitre Crassostrea gigas
1997 Catherine LARZUL Variabilité génétique d’une mesure in vivo du potentiel glycolytique musculaire chez le porc et relations avec d’autres caractères d’intérêt
1997 Régis d’ORGEVAL Analyse des systèmes d’élevage du porc local africain au Sud-Bénin
1996 Florence FOURNET Modélisation du fonctionnement d’une petite population en sélection

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F-75231 Paris Cedex 05
Tel: 33 (0) 1 44 08 18 43
Fax: 33 (0) 1 44 08 16 00
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