AgroParisTech est un établissement constitutif de l’Ecole Doctorale ABIES (Agriculture - Alimentation - Biologie - Environnements - Santé). ABIES compte environ 450 doctorants, dont 350 inscrits à AgroParisTech (tous secteurs scientifiques confondus). Chaque année, environ 70 thèses sont soutenues à AgroParisTech, dont de 3 à 7 dans le domaine de la génétique animale. Les thèses soutenues à AgroParisTech sont en principe mises en ligne sur le site ’Pastel’ de ParisTech, et dans la liste des thèses soutenues, nous fournissons le lien correspondant à chacune des thèses effectivement mises en ligne.
AgroParisTech is a founder part of the graduate school ABIES (agriculture - food - biology - environments - health). There are about 350 PhD candidates registred in AgroParisTech and a total of about 450 PhD candidates in ABIES (all scientific fields). Each year, about 70 PhD thesis are defended, including from 3 to 7 in the field of animal breeding and genetics.
Thèses en cours / Ongoing PhD thesis
Liste par date d’inscription / List by date of enrollment
| 2018 | Anna-Charlotte DOUBLET | Sélection et Diversité : gestion de la diversité génétique en sélection génomique |
| 2017 | Ronan GRIOT | Développement d’outils et méthodes de sélection génomique pour le bar et la daurade |
| 2017 | Jonathan d’AMBROSIO | Sélection génomique chez la truite arc-en-ciel |
| 2016 | Sébastien TAUSSAT | Etude du déterminisme génétique de l’efficacité alimentaire en bovins allaitants en vue d’une possible prise en compte dans les évaluations génomiques bovines |
| 2016 | Clémentine ESCOUFLAIRE | Détection de polymorphismes génétiques au niveau du génome mitochondrial et des chromosomes sexuels et caractérisation de leurs effets sur les caractères de production, reproduction et santé |
| 2016 | Marie BERODIER | Utilisation des données de génotypage en ferme pour une gestion optimisée et durable de l’élevage laitier |
| 2016 | Marie-Pierre SANCHEZ | Analyse génétique de la composition protéique et des aptitudes fromagères du lait de vache prédites à partir des spectres MIR |
| 2015 | Hadeer ABOSHADY | Biomarkers allowing the sustainable breeding for genetic resistance to gastro-intestinal nematodes in small ruminants under a tropical environment |
| 2015 | Md Mesbah UDDIN | Identification of causal factors for recessive genetic defects for embryonic lethality in dairy cattle combining whole exome and genome sequencing |
Thèses soutenues / Defended PhD thesis
Liste par date de soutenance / List by date of defense
| 2018 | Clémence FRASLIN | Bases génétiques de la réponse à l’infection par Flavobacterium psychrophilum chez la truite arc-en-ciel : approche expérimentale et perspectives en sélection |
| 2018 | Andrew MARETTE | Use of large scale cow genotyping to dissect the genetic determinism of complex traits beyond additive effects |
| 2018 | Alma RYSKALIYEVA | Exploring the fine composition of Camelus milk from Kazakhstan with emphasis on protective components |
| 2018 | Mathieu TIRET | Approche multi-locus du génome dans les modèles de génétique des populations |
| 2018 | Shizhi WANG | Selection for health in purebred dog |
| 2018 | Sonia EYNARD | Genetic erosion and long term genetic improvement |
| 2018 | Patrick AZEMA | Caractérisation des paramètres génétiques de la résistance à certains agents infectieux chez l’huître creuse, Crassostea gigas, dans le cadre de surmortalités estivales |
| 2018 | Doreen SCHWOCHOW | Molecular identification of colour gene patterns in birds |
| 2018 | Thérèse CALLET | Vers l’identification des fonctions impliquées dans les capacités de différents génotypes de truite arc-en-ciel (Oncorhynchus mykiss) à survivre et grandir avec un aliment uniquement à base de végétaux |
| 2017 | Zih-Hua FANG | Genomics of bovine milk protein composition |
| 2017 | Iola CROUE | Evaluation génétique et génomique de nouveaux caractères chez les bovins laitiers |
| 2017 | Christina ROCHUS | Genetics of coat colour and reproduction traits in sheep |
| 2017 | Tao XIANG | Genomic evaluation with cross-bred and pure-bred animals |
| 2017 | Pauline MICHOT | Utilisation des séquences ‘génome complet’ de taureaux fondateurs pour identifier des mutations délétères et améliorer la connaissance de la fonction des gènes bovin |
| 2017 | Parsaoran SILALAHI | Experimental assessment of the effects of selection on reproduction and robustness traits in a Large White pig population |
| 2017 | Mathieu BESSON | Using life cycle assessment to design breeding programs in aquaculture that balance productivity with environmental sustainability |
| 2016 | David JONAS | Evaluation of haplotype-based genomic selection methods with focus on their performances in a multi-breed context in dairy cattle |
| 2016 | Alexis MICHENET | Détection de QTL et sélection génomique des qualités maternelles des vaches allaitantes |
| 2016 | Belén JIMENEZ MENA | Estimation of the effective population size (Ne) and its application in the management of small populations |
| 2015 | Edin HAMZIC | Innate and adaptative immune parameters controlling two major diseases in chicken |
| 2015 | Irene VAN Den BERG | Use of whole sequence data in genomic selection of dairy cattle |
| 2014 | Chris HOZE | Evaluation génomique multiraciale des bovins laitiers |
| 2013 | Muhammad Zahid TAHIR | Rôle et mécanismes d’action de la progestérone pendant la période périovulatoire chez la chienne |
| 2013 | Clémence DESJARDIN | Bases moléculaires et physiopathologiques de la prédisposition à l’ostéochondrose équine |
| 2013 | Thierry TRIBOUT | Intérêt de la sélection génomique dans les programmes de sélection porcins : cas d’une lignée mâle de grande taille |
| 2013 | Eloi VERRIER | Bases génétiques de la résistance aux rhabdovirus et réponse cellulaire chez la truite arc-en-ciel : importance des mécanismes de défense innés |
| 2012 | Lucie CHEVALLIER | Recherche de facteurs génétiques contrôlant la résistance de lignées de souris consanguines à une infection expérimentale par Yersinia pestis, l’agent de la peste |
| 2012 | Pauline BRENAUT | Analyse fonctionnelle des mécanismes protecteurs des épithéliums induits par la sérum amyloïde A3 |
| 2012 | Coralie DANCHIN-BURGE | Combinaison de stratégies in situ et ex situ pour la gestion durable de la variabilité génétique des populations animales |
| 2012 | Romain SAINTILAN | Etude de nouvelles approches pour la sélection sur l’efficacité alimentaire chez le porc en croissance et des perspectives de leur mise en place |
| 2012 | Bérénice HUQUET | Adaptation de la sélection à la diversité des systèmes d’élevages en bovins laitiers |
| 2012 | Marc VANDEPUTTE | Genetic variation of growth and sex ratio in the European sea bass (Dicentrarchus labrax L.) as revealed by molecular pedigrees |
| 2012 | Romain DASSONNEVILLE | Genomic selection of dairy cows |
| 2012 | Mohamed KILEH WAIS | Méthodes statistiques pour la détection de QTL : nouveaux développements et applications chez le canard mulard |
| 2012 | Mélanie JAQUOT-GUNIA | Optimisation d’un programme de sélection de petits ruminants en milieu tropical |
| 2011 | Richard LE BOUCHER | Génétique de l’utilisation d’aliments d’origine végétale chez la truite arc-en-ciel et le bar européen |
| 2011 | Clotilde PRATY | Impacts of genomic selection on classical genetic evaluations |
| 2011 | Btissam SALMI | Méta-analyse et analyse multidimensionnelle : applications à la qualité de la viande de porc |
| 2011 | Sophie ALLAIS | Détection et validation de marqueurs génétiques impliqués dans la qualité de la viande bovine |
| 2011 | Chih-Sheng CHANG | A global approach of chicken genetic diversity in Taiwan, combining phenotypes and molecular markers |
| 2011 | Didier BOUCHEL | Caractérisation et cartographie des ressources génétiques caprines du Sénégal |
| 2010 | Aurélien CAPITAN | Caractérisation moléculaire de régions chromosomiques intervenant dans la variabilité de caractères d’intérêt chez les bovins laitiers |
| 2010 | Laure GRIMA | Etude des variations génétiques de la croissance et du sex-ratio chez le bar à partir de pedigrees moléculaires |
| 2010 | Olympe CHAZARA | Diversité génétique structurale et fonctionnelle du CMH chez le poulet : implication pour la résistance aux maladies |
| 2010 | Julien MARUOTTI | Comparison of epiblast stem cells from mouse fertilized and nuclear transfer embryos, and attempts to obtain embryo-derived pluripotent stem cells in a species of economic interest |
| 2009 | Charlène BLANCHET | Identification des facteurs génétiques contrôlant la résistance de lignées de souris consanguines à une infection expérimentale par Yersina pestis, l’agent de la peste |
| 2009 | Alban BOUQUET | Amélioration de l’efficacité des programmes de sélection des bovins allaitants : de nouveaux modèles d’évaluation génétique |
| 2009 | François GUILLAUME | Intégration de l’information moléculaire dans l’évaluation génétique |
| 2009 | Guillemette MAROT | Modélisation statistique pour l’analyse des données d’expression des gènes |
| 2009 | Slim BEN JEEMA | Cartographie fine des régions génomiques impliquées dans la variation des caractères de fertilité femelle des bovins |
| 2009 | Félicie FAUCON | Effet du polymorphisme au locus DGAT1 sur l’activité transcriptionnelle du tissu mammaire au cours de la lactation |
| 2008 | Hélène LECLERC | Mise en place d’une évaluation génétique sur les contrôles élémentaires en bovins laitiers et perspectives d’utilisation des résultats en appui technique |
| 2008 | Jean-Claude FOTSA | Caractérisation des populations de poules locales (Gallus gallus) au Cameroun |
| 2008 | Mylène DUVAL | Modélisation et estimation de variances hétérogènes |
| 2008 | Catherine RYHLMANN | Vers une évaluation génétique internationale des chevaux pour les performances en saut d’obstacle |
| 2008 | Grégoire LEROY | Diversité et gestion génétique des races canines |
| 2008 | Cécile BERTHOULY | Characterisation of the cattle, buffalo and chicken populations in the Northern Vietnamese province of Ha Giang |
| 2008 | Ingrid DAVID | Analyse génétique et modélisation de la production de semence et de la réussite de l’insémination artificielle en ovin |
| 2008 | Florence YTOURNEL | Déséquilibre de liaison et cartographie de QTL en population sélectionnée |
| 2007 | Adeline LAMBERT-DERKIMBA | L’inscription du type génétique dans les règlements techniques des produits animaux sous AOP : enjeux et conséquences pour la gestion collective des ressources génétiques |
| 2007 | Valérie LOYWYCK | Analysis of the within-population genetic diversity and the effective size based on different kinds of information in selected animal populations |
| 2007 | Clotilde DUBOIS | Modélisation des programmes de sélection dans l’élevage du cheval de sport français |
| 2007 | Giulietta MINOZZI | Characterisation of chicken lines selected on immune response : Crossbreeding and disease resistance |
| 2007 | Anne LAUVIE | Gérer les populations animales locales à petits effectifs : approche de la diversité des dispositifs mis en oeuvre |
| 2007 | Adalberto ROSENDO PONCE | Approches quantitatives et moléculaires de l’analyse de la variabilité génétique des performances de reproduction des truies |
| 2006 | Laurianne CANARIO | Caractérisation et étude de la variabilité génétique de la survie des porcelets en allaitement précoce |
| 2006 | Lydie N’DRI | Interactions génotype x milieu chez le poulet |
| 2006 | Jean-Luc GOURDINE | Analyse des contraintes du milieu tropical humide sur les performances des truies |
| 2006 | Chung-Ming CHANG | Identification de la base moléculaire de phénotypes présentant différentes colorations de plumage chez le poulet |
| 2004 | Sara CASU | Détection de QTL chez la brebis laitière, à partir du croisement entre les races Lacaune et Sarde |
| 2003 | Michel NAVES | Caractérisation et gestion d’une population bovine locale de la zone tropicale : le bovin Créole de Guadeloupe |
| 2003 | Zulma VITEZICA | Modèles d’hérédité mixte pour l’évaluation génétique des animaux |
| 2003 | Isabelle DELAUNAY | Méthodologie des évaluations génétiques internationales chez les bovins laitiers |
| 2003 | Carole MORENO | Analyse génétique de la sensibilité des ovins à deux pathologies infectieuses, la salmonellose et de la tremblante |
| 2003 | Hélène GILBERT | Multidimensionnalité dans la détection de gènes influençant les caractères quantitatifs. Application au porc |
| 2003 | Mathieu GAUTIER | Analyse fine d’une région du génome bovin |
| 2002 | Chih-Feng CHEN | Etude de l’adaptation à la chaleur de lignées de poules pondeuses combinant deux gènes majeurs |
| 2001 | Guillaume LAVAL | Choix des marqueurs et des méthodes pour la caractérisation génétique des races d’animaux domestiques |
| 2000 | Marie-Madeleine MIALON | La reproduction des vaches allaitantes : analyse de la variabilité individuelle et des relations entre les composantes de la reproduction |
| 2000 | Marie-Noëlle FOUILLOUX | Evaluation génétique des bovins allaitants sur performances bouchères post-sevrage |
| 2000 | Rachel RUPP | Analyse génétique de la résistance aux mam-mites chez les ruminants laitiers |
| 1999 | Virginie CLEMENT | Amélioration génétique des petits ruminants en milieu villageois africain |
| 1999 | Hector TADDEO | Amélioration génétique de la chèvre Angora en vue de la production de mohair |
| 1999 | Sandrine MIGNON | Etude génétique du dimorphisme sexuel chez les volailles domestiques |
| 1998 | Sophie LAUNAY | Recherches de marqueurs génétiques et évaluation de la variabilité chez l’huitre plate Ostrea edulis pour la résistance au parasite Bonamia oestrae |
| 1998 | Valérie KERDILES | Amélioration de la taille de portée chez le lapin : création et diffusion du progrès génétique |
| 1998 | Bertrand COLLET | Etude des bases génétiques de la variabilité des caractères physiologiques impliqués dans la croissance de l’huitre Crassostrea gigas |
| 1997 | Catherine LARZUL | Variabilité génétique d’une mesure in vivo du potentiel glycolytique musculaire chez le porc et relations avec d’autres caractères d’intérêt |
| 1997 | Régis d’ORGEVAL | Analyse des systèmes d’élevage du porc local africain au Sud-Bénin |
| 1996 | Florence FOURNET | Modélisation du fonctionnement d’une petite population en sélection |
