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AgroParisTech

Le Vivant, notre vocation

L’université Paris-Saclay voit officiellement le jour le 5 novembre 2019

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UFR Microbiologie et Génétique Moléculaire

Présentation de l’UFR

L’UFR Microbiologie et Génétique Moléculaire (MGM) propose une offre de formation variée en microbiologie qui s’appuie sur les quatre domaines d’excellence de ses enseignants en recherche fondamentale et appliquée :

  • Microbiologie des Systèmes et de Synthèse,
  • Microbiologie, Virologie et Pathogénicité,
  • Biotechnologie microbienne pour la Santé,
  • Ecologie microbienne et Nutrition

Les éléments de formation dispensés par l’UFR MGM permettent une spécialisation progressive des étudiants des cursus Ingénieur d’AgroParisTech et Master de l’Université Paris-Saclay en favorisant l’acquisition de compétences transversales (modélisation, statistiques, bioinformatique, etc…).

Directeur : Colin Tinsley
AgroParisTech, Centre de Grignon
CBAI, 78850 Thiverval-Grignon

colin.tinsley chez agroparistech.fr

Données et chiffres clés

- 7 enseignants-chercheurs
- 3 agents techniques

Enseignement

Les EC de l’UFR sont tous impliqués dans l’enseignement de la microbiologie générale et de la biologie moléculaire dans le bloc « Sciences du Vivant et du Milieu » du tronc commun de 1ère année du cursus ingénieur dans le cadre de l’UE « Biochimie - Génétique moléculaire - Microbiologie : comprendre et modifier le vivant à l’échelle moléculaire et cellulaire ». Colin Tinsley et Anne-Marie Davila sont responsables de la composante Microbiologie et Colin Tinsley et Anita Boisramé sont responsables de la composante Génétique moléculaire.

Tous les EC sont impliqués dans le tutorat de stages : ingénieur, master ou CEI. V. Sauveplane participe également à l’accompagnement des élèves AgroParisTech à travers les dispositifs LREM (La Recherche Et Moi - http://www2.agroparistech.fr/-La-recherche-et-moi-.html) et l’Itinéraire entrepreneuriat (http://www2.agroparistech.fr/Entrepreneuriat.html).

Par ailleurs, les activités d’enseignement plus spécifiques de l’UFR Microbiologie et Génétique moléculaire s’inscrivent dans les 4 domaines mentionnés dans la présentation et sont portés par au moins 2 enseignants-chercheurs. Elles s’inscrivent dans les 3 années du cursus ingénieur AgroParisTech et dans plusieurs Masters de l’Université Paris-Saclay notamment. Elles sont détaillées dans le lien « L’enseignement » et brièvement présentées ci-dessous :

• Axe « Microbiologie des Systèmes et de Synthèse » : Matthieu Jules et Vincent Sauveplane
Les enseignements de Biologie de Synthèse, qui regroupe deux approches complémentaires de compréhension et d’ingénierie du vivant pour la conception de systèmes biologiques pour les biotechnologies ; et de Biologie des Systèmes, qui apporte une vision multidisciplinaire et multi-échelle du fonctionnement global des organismes vivants, sont proposés sur les trois années du cursus Ingénieur d’AgroParisTech et au sein des Masters de l’Université Paris-Saclay (principalement au sein du M2 Systems and Synthetic Biology dont M. Jules est co-responsable (https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/formation/master/m2-systems-synthetic-biology-ssb#presentation-m2)) et aussi au sein des Masters de Sorbonne Université et de l’Université Sorbonne Paris Cité ou encore du cursus ingénieur de Centrale-Supelec).

• Axes « Microbiologie, Virologie et Pathogénicité » et « Ecologie microbienne et Nutrition » : Colin Tinsley, Anne-Marie Davila et Pierre-Henri Benetti
Les enseignements dispensés dans ce domaine concernent les trois années du cursus Ingénieur d’AgroParisTech et le Master de l’Université Paris-Saclay Nutrition et Science des Aliments (Anne-Marie Davila est co-responsable du M1 Nutrition et Science des Aliments (https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/education/master/m1-nutrition-et-sciences-des-aliments#presentation-m1)). Des cours, TD et TP portant sur la mise en place et l’évolution des écosystèmes microbiens, ou bien encore sur l’analyse de la biodiversité taxonomique et fonctionnelle des écosystèmes microbiens et enfin des enseignements permettant d’appréhender les relations hôte/microbiote intestinal en se focalisant sur les impacts sur la santé et le rôle des facteurs alimentaires sont proposés.

• Axe « Biotechnologie microbienne pour la Santé » : Aurélie Baliarda, Anita Boisramé, Pierre-Henri Benetti, Vincent Sauveplane et Colin Tinsley
Les enseignements en lien avec ce domaine sont majoritairement dispensés au sein des trois années du cursus ingénieur AgroParisTech et plus minoritairement dans l’enseignement au sein du Master de l’Université Paris-Saclay BIP (socle commun du M1 de la mention BIP (https://www.universite-paris-saclay.fr/fr/formation/master/biologie-integrative-et-physiologie#mention)). Aurélie Baliarda coordonne la dominante d’approfondissement Biotech d’AgroParisTech (http://www2.agroparistech.fr/BIOTECH.html) et Anita Boisramé est responsable du parcours BMC « Bioingénierie moléculaire et cellulaire » (http://www2.agroparistech.fr/Domaine-4-Ingenierie-et-sante.html#Parcours). Les enseignements portent essentiellement sur les approches de génétique moléculaire et de génomique permettant de développer des stratégies d’ingénierie métabolique ou cellulaire chez les microorganismes en lien avec la santé. Les TD et TP sont privilégiés en 1ère année et une formation par la recherche est dispensée en 3ème année.

Recherche

Les EC de l’UFR effectuent leur activité de recherche dans 2 unités INRA différentes qui sont l’Institut MICALIS (https://www.micalis.fr/) et l’unité PNCA (Physiologie de la Nutrition et du Comportement Alimentaire ; https://www6.jouy.inra.fr/pnca/).

Les enseignants-chercheurs

- Aurélie Baliarda, Maître de Conférences en Sécurité Microbiologique des Aliments et Ecologie Microbienne
aurelie.baliarda chez agroparistech.fr
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
Tél. : 01 30 81 59 26

MICALIS, UMR 1319
aurelie.baliarda chez inra.fr
INRA, Bât. 440, Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas Cedex
Tél. : 01 74 07 17 17

web

- Anita Boisramé-Baudevin, Maître de Conférences en Biologie moléculaire et génétique des levures, HDR
anita.boisrame chez agroparistech.fr
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
Tél. : 01 30 81 54 78

MICALIS, UMR 1319
anita.baudevin chez inra.fr
INRA, Bât. 440, Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas Cedex
Tél. : 01 74 07 16 24

web

- Pierre-Henri Benetti, Maître de Conférences en métabolismes microbiens
MGM, AgroParisTech
16 rue Claude Bernard
75231 Paris Cedex
Tél. : 01 44 08 18 26

PNCA, UMR UMR 914
16 rue Claude Bernard
75231 Paris Cedex
Tél. : 01 44 08 18 26
pierre-henri.benetti chez agroparistech.fr

web

- Anne-Marie Davila-Gay, Maître de Conférences en écologie microbienne pour la nutrition et la santé
MGM, AgroParisTech
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
Tél. : 01 30 81 52 49

PNCA, UMR UMR 914
16 rue Claude Bernard
75231 Paris Cedex
Tél. : 01 44 08 86 76
anne-marie.davila-gay chez agroparistech.fr

web

- Mathieu Jules, Professeur de biologie des systèmes et de synthèse
MGM, AgroParisTech
mathieu.jules chez agroparistech.fr
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
Tél. : 01 30 81 54 49

MICALIS, UMR 1319
mathieu.jules chez inra.fr
INRA, Bât. 440, Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas Cedex
Tél. : 01 34 65 29 56

web

- Vincent Sauveplane, Maître de conférences en biologie et de synthèse microbienne
MGM, AgroParisTech
vincent.sauveplane chez agroparistech.fr
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
Tél. : 01 30 81 54 78

MICALIS, UMR 1319
vincent.sauveplane chez inra.fr
INRA, Bât. 440, Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas Cedex
Tél. : 01 34 65 29 49

web

- Colin Tinsley, Professeur en génétique moléculaire
MGM, AgroParisTech
colin.tinsley chez agroparistech.fr
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
Tél. : 01 30 81 54 52

CIRM-Levures
colin.tinsley chez inra.fr
INRA, Bât. 440, Domaine de Vilvert
78352 Jouy-en-Josas Cedex
Tél. : 01 34 65 22 77

web

Personnel Technique

- Rahma Kazitani
MGM, AgroParisTech
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
rahma.kazitani chez agroparistech.fr

- Christina Vernant
MGM, AgroParisTech
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
christina.andrea.vernant chez agroparistech.fr

- Michèle Winkler
MGM, AgroParisTech
CBAI, Avenue Lucien Brétignières
78850 Thivernal-Grignon
michele.winkler chez agroparistech.fr

AgroParisTech
16 rue Claude Bernard
F-75231 Paris Cedex 05
Tel: 33 (0) 1 44 08 18 43
Fax: 33 (0) 1 44 08 16 00
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